今天,我想和大家分享一些關(guān)于cdna文庫(kù)以及cdna文庫(kù)的特點(diǎn)的問(wèn)題。以下是小編對(duì)這個(gè)問(wèn)題的總結(jié)。讓我們看一看。
cdna文庫(kù)和基因組dna文庫(kù)的區(qū)別
一、來(lái)源不同
CDNA:CDNA是以mRNA為模板,在適當(dāng)引物的存在下,由mRNA經(jīng)過(guò)反轉(zhuǎn)錄而得到的DNA,是mRNA鏈互補(bǔ)的DNA鏈。
基因組DNA:基因組DNA是指整套人類(lèi)基因結(jié)構(gòu),控制著人類(lèi)從一個(gè)單個(gè)細(xì)胞到一個(gè)復(fù)雜整體的發(fā)育。
二、所屬細(xì)胞類(lèi)型不同
CDNA:CDNA的基因可以來(lái)自于原核細(xì)胞,也可以來(lái)自于真核細(xì)胞。
基因組DNA:基因組DNA是指人類(lèi)基因,屬于真核細(xì)胞。
三、結(jié)構(gòu)不同
CDNA:cDNA內(nèi)部已無(wú)內(nèi)含子等結(jié)構(gòu)。
基因組DNA:基因組DNA通常存在內(nèi)含子等結(jié)構(gòu)。
擴(kuò)展資料
二代測(cè)序均是先將RNA反轉(zhuǎn)錄組成cDNA再進(jìn)行測(cè)序的。mRNA,并不是嚴(yán)格意義上的基因,而是基因信息的載體,稱(chēng)作Messenger RNA (mRNA),即信使核糖核酸。
“基因”是指負(fù)載特定生物遺傳信息,能夠產(chǎn)生一條多肽鏈或功能RNA所必需的DNA分子片段,不但包括編碼區(qū),還包括5′-端和3′-端兩側(cè)特異性序列,雖然這些序列不編碼氨基酸,但在基因表達(dá)的過(guò)程中起著重要的作用。
參考資料來(lái)源:百度百科-CDNA
百度百科-基因組DNA
什么是cDNA文庫(kù)?
也叫做部分基因文庫(kù),只包含了一種生物的部分基因所構(gòu)成的文庫(kù).
其實(shí)就是將一種生物體內(nèi)的部分基因通過(guò)基因工程的方式把這部分基因儲(chǔ)存在宿主細(xì)胞內(nèi),這時(shí)只需要培養(yǎng)這些宿主細(xì)胞就可以,而這些宿主細(xì)胞含有該生物的部分基因.這群宿主細(xì)胞構(gòu)成文庫(kù),就是該生物的cDNA文庫(kù)
cDNA文庫(kù)是什么?
部分基因文庫(kù)
cDNA是指以mRNA為模板,由逆轉(zhuǎn)錄酶催化形成的閉乎互轎早悉補(bǔ)DNA(cDNA),其核苷酸序列完全互補(bǔ)于模板mRNA鏈;再以cDNA為模板,由DNA聚合酶合成第二鏈,得到互補(bǔ)雙鏈DNA.由于模板mRNA含有該種細(xì)胞的各種mRNA分子,因而合成的cDNA產(chǎn)物是各種mRNA拷貝的混合物,然后將雙鏈產(chǎn)物與載體(質(zhì)?;蚴删w)DNA重組,并轉(zhuǎn)化到宿主細(xì)菌或包裝成噬菌體顆粒,得到一系列重組的克隆混合體.每個(gè)克隆含單獨(dú)一種mRNA分子,克睜拿隆總和則包含細(xì)胞的全部mRNA信息,即cDNA文庫(kù).
cdna文庫(kù)和基因組文庫(kù)的區(qū)別
cdna文庫(kù)和基因組文庫(kù)的區(qū)別如下:
基因文庫(kù)除基因組文庫(kù)還有部分基因文庫(kù)(如cDNA文庫(kù))。
基因文庫(kù)包括基因組文庫(kù)和部分基因文庫(kù)(如cDNA文庫(kù))。將含有某種生物不同基因的許多DNA片段,導(dǎo)入受體菌的群體中儲(chǔ)存,各個(gè)受體菌分別含有這種生物的不同的基因,稱(chēng)為基因文庫(kù)。如果這個(gè)文庫(kù)包含了某種生物的所有基因,那么,這種基因文庫(kù)叫做基因組文庫(kù)。
如果這個(gè)文庫(kù)只包含了某種生物的一部分基因,這種基因文庫(kù)叫做部分基因文庫(kù),例如cDNA文庫(kù),首先得到mRNA,再反轉(zhuǎn)錄得cDNA,形成文庫(kù)。cDNA文庫(kù)與基因組文庫(kù)的區(qū)別在于cDNA文庫(kù)在mRNA拼接過(guò)程中已經(jīng)除去了內(nèi)含子等成分,便于DNA重組時(shí)直接使用。
用限制性?xún)?nèi)切酶切割細(xì)胞的整個(gè)基因組DNA,可以得到大量的基因組DNA片段,然后將這些DNA片段與載體連接,再轉(zhuǎn)化到細(xì)菌中去,讓宿主菌長(zhǎng)成克隆。這樣,一個(gè)克隆內(nèi)的每個(gè)細(xì)胞的載體上都包含有特定的基因組DNA片段,整個(gè)克隆群體就包含基因組的全部基因片段總和稱(chēng)為基因組文庫(kù)。
將某種生物的基因組DNA切割成一定大小的片段,并與合適的載體重組后導(dǎo)入宿主細(xì)胞進(jìn)行克隆。這些存在于所有重組體內(nèi)的基因組DNA片段的集合,即基因組文庫(kù),它包含了該生物的所有基因。
基因組dna文庫(kù)和cdna文庫(kù)的區(qū)別
cdna文庫(kù)不同于基因組文庫(kù),被克隆dna是從mRNA反轉(zhuǎn)錄來(lái)源的dna。cdna組成特點(diǎn)是其中不含有內(nèi)含子和其他調(diào)控序列。
cdna文庫(kù)
以mRNA為模板,經(jīng)反轉(zhuǎn)錄酶催化,在體外反轉(zhuǎn)錄成cDNA,與適當(dāng)?shù)妮d體常用噬菌體或質(zhì)粒載體連接后轉(zhuǎn)化受體菌,則每個(gè)細(xì)菌含有一段cDNA,并能繁殖擴(kuò)增,這樣包含著細(xì)胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合稱(chēng)為該組仿鍵織細(xì)胞的cDNA文庫(kù)?;蚪M含有的基因在特定的組織細(xì)胞中只有一部分表達(dá),而且處在不同環(huán)境條件、不同分化時(shí)期的細(xì)胞其基因表達(dá)的種類(lèi)和強(qiáng)度也不盡相同,所以cDNA文庫(kù)具有組織細(xì)胞特異性。cDNA文庫(kù)顯然比基因組DNA文庫(kù)小得多,能夠比較容易從中篩選克隆得到細(xì)胞特異表達(dá)的基因。但對(duì)真核細(xì)胞備純巧來(lái)說(shuō),從基因組DNA文庫(kù)獲得的基因與從cDNA文庫(kù)獲得的不同,基因組。DNA文庫(kù)所含的是帶有內(nèi)含子和外顯子的基因組基因,而從cDNA文庫(kù)中獲得的是已經(jīng)過(guò)剪接、去除了內(nèi)含子的cDNA
基因組文庫(kù)
用限制性?xún)?nèi)切酶褲拆切割細(xì)胞的整個(gè)基因組DNA,可以得到大量的基因組DNA片段,然后將這些DNA片段與載體連接,再轉(zhuǎn)化到細(xì)菌中去,讓宿主菌長(zhǎng)成克隆。這樣,一個(gè)克隆內(nèi)的每個(gè)細(xì)胞的載體上都包含有特定的基因組DNA片段,整個(gè)克隆群體就包含基因組的全部基因片段總和稱(chēng)為基因組文庫(kù)。
將某種生物的基因組DNA切割成一定大小的片段,并與合適的載體重組后導(dǎo)入宿主細(xì)胞進(jìn)行克隆。這些存在于所有重組體內(nèi)的基因組DNA片段的集合,即基因組文庫(kù),它包含了該生物的所有基因。
什么是 cdna文庫(kù)?同基因組文庫(kù)有何差別
(1)cDNA文庫(kù)是指細(xì)胞全部mRNA通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄得到cDNA后被克隆的總和。cDNA的組成特點(diǎn)是片段中不含基因的內(nèi)含子和其他調(diào)控序列。
cDNA文庫(kù)構(gòu)建基本步驟:①制備mRNA:全RNA提取與mRNA的分離提純;②合成cDNA:oligo dT與mRNA3’端poly(A)雜交作為引物合成第一鏈,第二鏈合成是以第一鏈為模板,DNA聚合酶催化。常用RNase H切割mRNA-cDNA雜合鏈中的mRNA序列產(chǎn)生的小片段為引物合虛讓成第二鏈的片段,再連接成完整鏈;③制備載體則握DNA:由于cDNA分子的長(zhǎng)度在0. 5~8kb,差盯局常用的質(zhì)粒載體和噬菌體載體都可以,載體選擇根據(jù)文庫(kù)用途確定,如噬菌粒載體具有噬菌體的高效性和質(zhì)粒載體系統(tǒng)可以利用藍(lán)白斑篩選的便利;④cDNA的分子克?。篶DNA連入載體,轉(zhuǎn)化重組體,擴(kuò)增;⑤對(duì)構(gòu)建的cDNA文庫(kù)進(jìn)行鑒定,測(cè)定文庫(kù)包含的克隆數(shù),評(píng)價(jià)文庫(kù)質(zhì)量。文庫(kù)是否有價(jià)值主要從文庫(kù)含量和插入片段的大小來(lái)評(píng)價(jià),所構(gòu)建文庫(kù)必須有足夠多的克隆數(shù)以確保基因組cDNA每一個(gè)序列至少有1個(gè)拷貝在文庫(kù)內(nèi)。
(2)cDNA文庫(kù)同基因組文庫(kù)的差別主要在于基因組文庫(kù)(尤其是真核生物的基因組文庫(kù))可能包含有非編碼序列,含有更豐富的遺傳信息。
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